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法律分析：
水利基金按经营收入的千分之一缴纳。水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金，不是税。水利建设基金的计税依据是不含税收入。按月征收。凡有销售收入和营业收入的企事业单位和个体经营者，按其上年销售收入或营业收入的0.6‰征收地方水利建设基金。 按月或者季度的。
法律依据：
《财政部 国家税务总局关于扩大有关政府性基金免征范围的通知》 第一条 将免征教育附加、地方教育附加、水利建设基金的范围由现月销售额或营业额不超过三万，季销售额或营业额不超过10万的缴纳义务人扩大到月销售或营业额不超过10万，季销售额或营业额不超过30万的缴纳义务人。
水利基金的计税依据分不含税收入和实际缴纳的增值税、消费税两种情况。一、不含税收入：部分省份水利基金的计税依据是企业的不含税销售收入。具体来讲，企业在计算水利基金时，按照企业账薄或财务报表里面记载的销售收入或营业收入，作为计算水利基金的计税依据。
各省水利基金的具体比例不同。浙江省水利基金的计税比例是0.01%；而湖南省水利基金的计税比例是0.06%。水利基金在制定具体纳税比例时，可以根据自己省的实际情况进行制定。
二、实际缴纳的增值税、消费税：部分省份水利基金的计税依据是实际缴纳的增值税、消费税。在计算水利基金时，山东省选择的就是这种办法。山东省水利基金的税率是1%。虽然山东省水利基金的计税比例是1%，但是在2021年山东已经不再征收地方水利建设基金。不仅如此，就是在2020年山东省实际征收时，水利建设基金的税率也不是1%，而是按照0.5%的优惠税率进行征收。
另外，对于企业按照不含税的销售收入计算水利基金时，如果是差额征收的纳税人，计算水利基金时，按照差额后的不含税销售额计算水利基金。
水利基金按经营收入的千分之一缴纳。水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金，不是税。水利建设基金的计税依据是不含税收入。按月征收。凡有销售收入和营业收入的企事业单位和个体经营者，按其上年销售收入或营业收入的0.6‰征收地方水利建设基金。 按月或者季度的。
水利建设基金的计税依据及税率计算有两种方式：
1、水利建设基金的计税依据是不含税收入。水利建设基金应按照销售收入的0。1%来计提和交纳。
2、水利建设基金的计税依据是按照增值税、消费税实际缴纳额的1%来计提和交纳。
一、水利建设基金的计税依据是不含税收入。
水利建设基金应按照销售收入的0。1%来计提和交纳。
各省市的征收比例各不相同，如湖南省0。06%来计提和交纳。浙江省是0。01%。根据浙江省财政厅浙江省地方税务局关于暂停向企事业单位和个体经营者征收地方水利建设基金的通知的规定，自2016年11月1日（费款所属期）起，暂停向企事业单位和个体经营者征收地方水利建设基金。
各省市税务局负责征收行政区域内从事生产、经营的单位和个人的水利建设基金。
二、水利建设基金的计税依据是按照增值税、消费税实际缴纳额的1%来计提和交纳。
例如：在山东省行政区域内缴纳增值税、消费税的企事业单位和个体经营者，以其实际缴纳的增值税、消费税税额为计税依据，与对应的增值税、消费税同时向税务机关办理地方水利建设基金申报。
自2017年6月1日起至2020年12月31日，减半征收地方水利建设基金，由按照增值税、消费税实际缴纳额的1%调整为0。5%。
法律依据：
《财政部 国家税务总局关于扩大有关政府性基金免征范围的通知》
第一条 将免征教育附加、地方教育附加、水利建设基金的范围由现月销售额或营业额不超过三万，季销售额或营业额不超过10万的缴纳义务人扩大到月销售或营业额不超过10万，季销售额或营业额不超过30万的缴纳义务人。
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